Maestría en Bioinformática
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/20.500.12585/11822
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Item Aproximación genómica de la enfermedad periodontal causada por porphyromonas gingivalis(08/06/2022) Plazas Román, Jaime Enrique; Cuesta Astroz, Yesid; Fennix Agudelo, Mary Andrea; Chavarro Mesa, Edisson; Harris Ricardo, Jonathan; Díaz Caballero, AntonioOBJETIVO: El propósito del trabajo fue analizar la literatura científica con relación a la diversidad genómica y funcional de las cepas de P. gingivalis implicadas en la enfermedad periodontal. METODOLOGÍA: Se realizó un análisis la literatura científica de la plataforma PATRIC (Pathosystem Resource Integration Center), comparando genómicamente las cepas de Porphyromonas gingivalis implicadas en la enfermedad periodontal, se realizó la filogenia de los genomas (Phylogenetic Tree Building Service), se calcularon los datos del subsistema para cada genoma, la similitud de secuencia de nucleótidos se realizó con el servidor web (JSpeciesWS) y se analizaron los genes conocidos de resistencia a antibióticos en las bases de datos de resistencia antibiótica (CARD y NDARO). RESULTADOS: A través de la filogenia se observaron 3 clados, una identidad de nucleótidos de las 49 cepas en rangos comprendidos entre 99.9% y 98.25%, Se observan resistencias a antibióticos en las 49 cepas, solo se encontraron factores de virulencia en 7 cepas y ausencia de profagos en 2 cepas KCOM 2800 y WW3040. CONCLUSIÓN: En la base de datos PATRIC se encontraron 61 cepas de P. gingivalis, de las cuales 49 cepas estuvieron involucradas en la enfermedad periodontal específicamente en la periodontitis. También se observó que filogenéticamente se encontraban en 3 clados. Existe una diversidad marcada en las 49 cepas de la P. gingivalis, esta identidad de nucleótidos deja entrever que la similitud esta entre 99.9% a 98.25%, por lo tanto, no están tan separadas a nivel de nucleótidos. Las 49 cepas observadas evidenciaron resistencia antibiótica. Con respecto a los genes especiales de homólogos humanos, reportados en la plataforma PATRIC, solo 7 de las 49 cepas lo poseen. Finalmente, solo las cepas KCOM 2800 y WW3040 no están involucradas en los subsistemas y presentan ausencia de prófagos.
